RESUMO Algodão de seda é uma espécie vegetal adaptada a vários ecossistemas e tem se destacado pela importância econômica e ecológica. Nós avaliamos o perfil de amplificação de 23 iniciadores ISSR e selecionamos loci polimórficos para estudos genéticos de uma população natural de Calotropis procera por meio da coleta e extração de DNA genômico de 33 indivíduos. O DNA genômico foi extraído usando o protocolo sorbitol e CTAB 2% e os produtos de amplificação ISSR foram resolvidos por eletroforese. Com base no perfil de amplificação, os 23 iniciadores foram classificados como adequados, razoáveis e inadequados. Descrevemos a qualidade dos iniciadores considerando o número total de bandas, média das bandas por iniciador, porcentagem de polimorfismo, diversidade genética de Nei (heterozigosidade esperada - He), assumindo o equilíbrio de Hardy-Weinberg e conteúdo das informações polimórficas (PIC). Todos os iniciadores ISSR apresentaram perfil de amplificação, os quais geraram 173 marcas com média de 7,5 loci por iniciador. Porém, dos 23 iniciadores testados, apenas 18 permitiram amplificação visível e de alta qualidade, que foram classificados como adequado e polimórfico. Também observamos média de 0,30 e 0,24 para as estimativas de PIC e He, respectivamente. Os iniciadores DiCA3`RG, TriAGA3`RC e TriCGC3`RC foram altamente transferíveis para C. procera (apresentaram qualidade para amplificação com boa reprodutibilidade), com valores de PIC superiores a 0,40, He superior a 0,30 e polimorfismo superior a 86%.

ABSTRACT Sodom apple is a plant species adapted to various ecosystems and has stood out for its economic and ecological importance. We evaluated the amplification profile of 23 ISSR primers and selected polymorphic loci for genetic studies of a natural population of Calotropis procera by collecting and extracting genomic DNA from 33 individuals. Genomic DNA was extracted using the sorbitol protocol and 2% CTAB and the ISSR amplification products were resolved by electrophoresis. Based on the amplification profile, the 23 primers were classified as suitable, moderate, and unsuitable. We described the quality of primers considering the total number of bands, mean bands per primer, percentage of polymorphism, Nei’s genetic diversity (expected heterozygosity – He), assuming Hardy-Weinberg equilibrium and the polymorphic information content (PIC). All ISSR primers showed an amplification profile, which generated 173 bands with an average of 7.5 loci per primer. However, only 18 out of the 23 tested primers allowed visible and high-quality amplification, which were classified as suitable and polymorphic. We also observed a mean of 0.30 and 0.24 for PIC and He estimates, respectively. The DiCA3`RG, TriAGA3`RC, and TriCGC3`RC primers were highly transferable to C. procera (they presented quality for amplification with good reproducibility), with PIC values higher than 0.40, He higher than 0.30, and polymorphism higher than 86%.

Neste estudo, objetivando caracterizar o gradiente de resistência à podridão-parda em 217 genótipos de cacaueiro, foi realizado experimento de inoculação em disco foliar. Os parâmetros intervalo de tempo para avaliação, número de folhas avaliadas por genótipo e distribuição dos tratamentos experimentais foram avaliados. Observou-se diferença significativa entre os genótipos, possibilitando a separação dos mesmos em cinco grupos homogêneos (p < 0,01). Para as avaliações do teste de discos foliares, realizadas cinco e sete dias após a inoculação, foi observado maior valor de F aos sete dias, separando melhor os genótipos resistentes dos susceptíveis. Não houve diferença entre os clones quanto a utilização de mais de uma caixa para acomodação dos genótipos (p = 0,56) e a utilização de folhas diferentes do mesmo genótipo (p = 0,08). O gradiente de resistência observado na população indica que a mesma apresenta variabilidade desejada para fins de mapeamento e melhoramento genético do cacaueiro.

To characterize the gradient of resistance to black pod disease experimentally, the leaf disk assay was applied to 217 cocoa genotypes. The parameters time interval, number of leaves evaluated per genotype and distribution of experimental treatments were evaluated. Significant differences between genotypes were found, resulting in the grouping in five homogenous groups (p < 0.01). In the assessments with the leaf disk test, five and seven days after inoculation, the F value was highest after seven days, clearly separating the resistant from susceptible genotypes. There was no difference between the clones behavior and the use of more than one box to group the genotypes (p = 0.56) and the use of different leaves of the same genotype (p = 0.08). The resistance gradient observed indicates variability enough for mapping and cocoa breeding in the population.

O objetivo deste trabalho foi comparar métodos de caracterização da resistência do cacaueiro (Theobroma cacao) à podridão-parda (Phytophthora palmivora). Foram estudados os métodos escala de notas, índice de intensidade de infecção e índice de doença. Discos foliares de 103 genótipos receberam 0,2 mL de uma suspensão com 3x10(5) zoósporos de P. palmivora por mililitro, e os sintomas foram avaliados pelos três métodos. Foram realizadas três avaliações (repetições) por genótipo, cada uma composta por 20 discos. O método do índice de doença foi o mais eficiente em caracterizar a resistência de genótipos de cacaueiro a P. palmivora.

The objective of this work was to compare methods for characterizing the resistance of cacao (Theobroma cacao) to black pod (Phytophthora palmivora). The methods of disease scores, intensity of infection index and disease index were evaluated. Leaf discs of 103 genotypes were infected with 0.2 mL of a suspension with 3x10(5) zoospores of P. palmivora per milliliter, and symptoms were evaluated by the three methods. Three evaluations (replicates) composed by 20 discs each were carried out for every genotype. The disease index method was the most efficient to characterize the cacao resistance to P. palmivora.